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特别求了四代火影，让他以叛忍的身份出逃木叶，造成他无处可归的假象。
他离开木叶不久，就因为自身是宇智波后裔，加上能力不凡的缘故，很多组织和国家找上他，或明或暗的想要拉拢他，甚至威逼利诱，但都被鼬避开或拒绝了。
直到有一天，他去了雨之国，才遇到一个特别的男人。
那男人自称阿飞，愿意帮助鼬避被木叶追杀，甚至愿意帮他把木叶毁灭，这样一来，鼬便不必东躲西藏，可以重新获得自由。
鼬假意考虑了几天，最终还是答应了他的条件，并且加入了他的组织，‘晓’。
鼬在‘晓’的期间，获得了很多情报，但阿飞也不是傻瓜，把他监视的相当严密，更别提自己将这些情报送回木叶，不过还好，止水在暗中帮助着他，不仅如此，鼬还在晓里遇到了大蛇丸，而大蛇丸也对鼬产生了兴趣，甚至愿意帮他把很多机密消息传递回木叶，这样一来，三人里应外合，最终得到了不少有关当年事情的机密消息，甚至包括‘晓’的目的，以及中忍考试的猫腻。
这时候，阿飞也发现鼬的别有用心，自然不会甘心让他带着机密离开，于是直接朝鼬展开了攻击，两人缠斗了很久，鼬若不是有万花筒写轮眼庇护，加上止水和大蛇丸的暗中周旋，恐怕没命重新站在木叶的土地上了。
这其中的惊险，也只有他和止水心里明白，听他说起与阿飞战斗的事情，坐在鼬身边的止水忍不住握紧了鼬的手，像是回想起了胆战心惊的画面一样。
“总之，这件事的前因后果就是这样，我的确是假意叛逃，为的就是为宇智波一族洗清冤屈，但我也承认，没有真正把你当做一名预备下忍，担忧你不能替我保全秘密，才会欺骗了你，对此，我很抱歉，佐助，”说完了整件事情的经过，鼬突然发现自己变得轻松了许多，压在肩头的重担一下子轻快了，也似乎可以找人来分担了，“我也请你理解作为一名兄长的担忧，不愿意让自己的弟弟去参与其中，甚至为我担忧，你是一个好孩子，也是一个不输于我的天才少年，所以我相信你一定会明白我的苦衷的，因为作为兄长，我是真的很爱你。”
这是鼬头一次当着这么多人对兄弟表达自己的感情，多少有些不自在，但还是强迫自己说清楚，不想再造成什么误会。
佐助没想到鼬的心里压着这么多的事情，又这么直截了当的听到他表达的情感，不禁有些害羞，一方面为自己的狭隘感到羞愧，另一方面又为鼬经历的惊险感到庆幸，不禁有些别扭起来，“……你以后真的不会在做这种事情了吗？”
他能这么说，就表示已经不在意鼬的欺骗，也理解了鼬的苦衷了，只是碍于面子，不好意思直接原谅他罢了。
一旁的鸣人一下就听出了他的意思，用胳膊肘拐了拐春野樱，笑嘻嘻的指着佐助，一副偷笑的表情，春野樱也明白他的意思，两人笑成了一团，倒是默契的没有出声让佐助难堪就是了。
毕竟他们俩谁也不想被写轮眼修理。
“当然，我保证，而且今天这么多人在场，也算是做个见证吧，”鼬点了点头，郑重其事，“你已经成为了中忍，让我看到你的成长，所以从今往后，我不会再把你当成弟弟，而是当做同辈的忍者，决不食言。”
佐助点了点头，终于露出了一丝笑意。
话既然说开了，佐助也就有了决心，他思量了一下，看向水门，“火影大人，我还是愿意按照之前的约定，跟樱和鸣人一样，加入暗部。”
只是这一次，他的目标不再是追杀叛忍宇智波鼬，而是要去体会鼬的想法和决定，甚至代替鼬，为宇智波一族洗刷冤屈。
“既然如此，那我就安排你们进入暗部的相关程序，只是我要提醒你们，暗部不同与普通的忍者队伍，你们除了增强自己的实力之外，也要学会和更多人保持默契，甚至要习惯于看待残忍的画面，明白吗？”水门并不是在吓唬他们，既然他们决意进入暗部，那作为火影，他也不会偏颇任何一人，所以能不能在暗部站稳脚跟，就要看他们自己的造化和修行了。
“明白了！”三个新晋中忍互看一眼，信心十足的回应。
水门满意的点了点头，又嘱咐了鼬几句，便起身离开了。
佐助他们并没有急着离开，而是仔细询问了一下鼬的身体情况，这件事他一直挂在心里，只是碍于心结未解，不愿多问罢了，“那你身体没事吗，为什么要住院？”
止水看了鼬一眼，刚要说话，结果被鼬按住了胳膊，主动开口，“只是和那名自称为阿飞的男人战斗时受了些伤，四代目出于对我的关心和安全考虑，才让我入院治疗的。”
宇智波鼬回到木叶，一族里也有不少心存不满的人对他进行诋毁，这点佐助也知晓，便没有怀疑，而是问了另一个问题，“万花筒写轮眼是什么？”
鼬心里已经，倒也面不改色，淡定自若的道，“是写轮眼更高一层的忍术，但却是s级别的，等你的实力再增强一些，我就告诉你。”
“这样啊……”佐助点了点头，不疑有他，也明白自己现在对写轮眼运用的能力还有待开发，不能操之过急，便跟鼬又闲聊了几句，就和春野樱与鸣人离开了。
他们一走，鼬便松了口气，有些埋怨的看向止水，皱起眉头，“你刚刚是想告诉他吗？”
“哪有，是你自己说得不会再欺骗佐助，我可没这么说过，”止水一脸无辜，把责任推到他身上，“刚刚还是你说不要把佐助当弟弟了，当后辈看的，转头你就言不由衷了。”
“……那能一样吗？你是想让佐助也开眼万花筒，落得和我一眼瞎眼的下场？”对于这点，鼬绝对坚持，眉眼间变得严厉起来，“佐助即便已经是中忍，我也不会让他开眼万花筒的，你不是不知道，万花筒的残忍！”
止水沉吟了一下，也明白其中的道理，抱歉的看向鼬，“我知道你的意思，只是……也罢，如果大蛇丸大人能让万花筒不再遭受失明之苦再说也不迟，是我大意了。”
鼬的脸色这才缓和，拍了拍他的手，“止水，我知道你为了我好，在我心里，你就像我的兄长一样，处处为我考虑……”
止水脸色一僵，表情有些阴晴不定，苦着脸道，“你只是把我当成兄长？真的吗？鼬，就只是兄长而已？”
他不死心的追问让鼬也忍不住失笑，淡淡的道，“我不敢，也没资格把你当成别的，止水，我们之间是……”
“我们之间的事情，等你眼睛能够痊愈再说，”止水不愿听他拒绝的话，制止他继续说下去，半开着玩笑，“如果你一辈子好不了，就别想着逃脱我的手掌心了。”
鼬只得闭嘴，视线里是他模糊的面容，心里多少有些苦涩，只能笑着摇了摇头，不再言语。
几天过后，春野樱三人终于接到了进入暗部的通知，并按照规定